162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3417 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40290  LasA protease precursor  86.36 
 
 
418 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0437567  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3417  LasA protease precursor  100 
 
 
418 aa  849    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.38875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4241  peptidase M23B  51.98 
 
 
430 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2622  peptidase M23B  55.87 
 
 
432 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  33.92 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  32.91 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  32.91 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  32.91 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  28.95 
 
 
954 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  25.14 
 
 
597 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  35.16 
 
 
482 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2358  Peptidase M23  32.61 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  27.43 
 
 
630 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0055  Peptidase M23  30.45 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.738429  decreased coverage  0.00000593211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  30.64 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5290  peptidase M23B  29.41 
 
 
554 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  30.77 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2357  Peptidase M23  29.19 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  28 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  31.11 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.78 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  35 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  37.36 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  38.1 
 
 
669 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.78 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.54 
 
 
527 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3056  hypothetical protein  28.12 
 
 
579 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000386731  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  30.37 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  21.89 
 
 
268 aa  50.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  35.11 
 
 
307 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  41.27 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  34.86 
 
 
287 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  27.36 
 
 
599 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2287  peptidase M23B  34 
 
 
331 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.93 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  33.71 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  38.81 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  37.5 
 
 
321 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.96 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.08 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  29.66 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  38.14 
 
 
539 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  37.5 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  31.58 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2489  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  27.04 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.13 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  30.38 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  38.36 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  37.04 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  31.06 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.48 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  33 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  25.47 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  35.51 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  32.04 
 
 
648 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  28.87 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  31.15 
 
 
300 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 
313 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  31.85 
 
 
319 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.11 
 
 
244 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.31 
 
 
277 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
273 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.7 
 
 
441 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  26.32 
 
 
465 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  34.83 
 
 
293 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  41.27 
 
 
727 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  31.48 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  29.71 
 
 
615 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  41.27 
 
 
727 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  35.16 
 
 
280 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  37.68 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.09 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  33.33 
 
 
697 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  33.33 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  35.82 
 
 
649 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  38.1 
 
 
592 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  31.54 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  34.09 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  33.33 
 
 
697 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  31.62 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.8 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  38.1 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  42.11 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.16 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.52 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  37.31 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  35.11 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  35.82 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.61 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  32.84 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  32.46 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  38.81 
 
 
363 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  31.78 
 
 
1048 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  37.5 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  32.53 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.7 
 
 
301 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  32.53 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  34.78 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>