204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1375 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  100 
 
 		 415 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  69.14 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  57.75 
 
 		 577 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  49.46 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  26.11 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.58 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  22.65 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.21 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.91 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.62 
 
 		 495 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  22.95 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  24.8 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  21.71 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  21.13 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  22.51 
 
 		 869 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  20.74 
 
 		 915 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.78 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 834 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  19.63 
 
 		 920 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  21.05 
 
 		 910 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 921 aa  60.1  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  19.56 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  19.56 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  20.3 
 
 		 931 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  20.3 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  24.72 
 
 		 952 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  19.5 
 
 		 912 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  31.07 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  21.25 
 
 		 833 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  23.38 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  20.12 
 
 		 828 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.3 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  22.54 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  21.5 
 
 		 948 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  38.14 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  20.22 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  21.97 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  17.98 
 
 		 753 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 200 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  29.03 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  29.03 
 
 		 558 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  29.03 
 
 		 558 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  20.94 
 
 		 277 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  21.93 
 
 		 936 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  22.12 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  18.89 
 
 		 919 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  19.64 
 
 		 869 aa  53.5  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  17.81 
 
 		 849 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  20.77 
 
 		 781 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  23.6 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 603 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 837 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 837 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 837 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  20.73 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  40 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  23.66 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  36.26 
 
 		 243 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  34.41 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  22.6 
 
 		 580 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  19.03 
 
 		 869 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  19.24 
 
 		 386 aa  51.2  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  22.41 
 
 		 977 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  19.44 
 
 		 277 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  20.77 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  23.12 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  32.43 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 191 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 237 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  21.63 
 
 		 779 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 186 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  23.98 
 
 		 282 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  32.84 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  21.86 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>