More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0445 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  96.25 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  95.88 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  91.76 
 
 		 267 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  60.47 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  58.89 
 
 		 270 aa  351  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  60.08 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  62.21 
 
 		 291 aa  349  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  59.19 
 
 		 274 aa  349  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  61.63 
 
 		 275 aa  341  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.91 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  40.73 
 
 		 321 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  39.71 
 
 		 315 aa  228  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  37.55 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 320 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 320 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  39.78 
 
 		 328 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  36.01 
 
 		 360 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.98 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  37.4 
 
 		 308 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  36.68 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  38.11 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.77 
 
 		 304 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  36.58 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  33.59 
 
 		 299 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  47.97 
 
 		 351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.85 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  33.6 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  35.56 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.4 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.91 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.58 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.2 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  26.42 
 
 		 337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 		 337 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 		 399 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 		 211 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  28.73 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 405 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  27.52 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.87 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 		 351 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 394 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  29.82 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  29.86 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28.52 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.3 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28.52 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  29.3 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  30.3 
 
 		 384 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  47.19 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  26.24 
 
 		 426 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  47.19 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1708  cytochrome c oxidase subunit II  27.76 
 
 		 320 aa  99  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  27.95 
 
 		 280 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 		 358 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  44.94 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  28.73 
 
 		 390 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 		 389 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 		 418 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 		 389 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  25.83 
 
 		 359 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 544 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 517 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 525 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 525 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 517 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 		 418 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 517 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 525 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 		 525 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  26.51 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  27.94 
 
 		 355 aa  95.5  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 		 388 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  29.02 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  26.79 
 
 		 532 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.95 
 
 		 538 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  28.69 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>