More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56209 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_56209  diadenosine polyphosphate hydrolase  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.270188 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06189  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11700)  45.83 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196952 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  41.74 
 
 		 160 aa  98.2  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  39.33 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  29.58 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  28.57 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  37.23 
 
 		 1077 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  44.87 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  35.87 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  37.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  31.18 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  29.27 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  40.24 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  37.84 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  36.17 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  32.98 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  37.08 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  32.22 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  31.91 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  26.6 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  33.7 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  29.67 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.07 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  31.87 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  32.98 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  29.47 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  26.6 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  32.98 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01930  nucleoside-triphosphatase, putative  36.27 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  36.9 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  32.65 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.22 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  31.31 
 
 		 130 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  27.37 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  32.97 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  31.63 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  31.52 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14064  predicted protein  32.58 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  27.84 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  32.63 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  28.42 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  28.23 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  32.98 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  28.72 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  28.72 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.09 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  27.37 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>