71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54137 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  100 
 
 		 363 aa  749    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  39.48 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  28.01 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  30 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.89 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  27.73 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  30.48 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  28.9 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  27.35 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.72 
 
 		 327 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  26.24 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  26.8 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  29.06 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  31.66 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  26.59 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  26.48 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.5 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  29.12 
 
 		 358 aa  99.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  32.34 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  26.44 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.39 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  29.12 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  27.38 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  28.63 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.43 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  28.3 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  31 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.58 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  27.43 
 
 		 658 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  27.08 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  29.5 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.39 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  24.91 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  26.55 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  26.72 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  24.52 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  25.62 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  24.81 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  25.55 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  48.65 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  25.55 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.75 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  28.68 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  27.24 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  26.85 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  26.05 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  31.43 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  26.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  27.61 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  28.32 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  25.8 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  27.88 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  31.33 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.33 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  26.61 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  27.04 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  24.03 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  26.25 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  23.19 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  22.56 
 
 		 216 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31781  predicted protein  27.16 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  37.84 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  22.56 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  27.27 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.13 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  23.64 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  31.78 
 
 		 422 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  24.48 
 
 		 457 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>