More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48154 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48154  predicted protein  100 
 
 
840 aa  1751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31007  predicted protein  41.74 
 
 
655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.906185  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37206  predicted protein  42.95 
 
 
698 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.55659  normal  0.224947 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36629  predicted protein  38.4 
 
 
700 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.562122  hitchhiker  0.00135175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27152  predicted protein  38.4 
 
 
700 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.652588  normal  0.205318 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19070  predicted protein  36.62 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00757  methyltransferase (Ncl1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14180)  34.21 
 
 
990 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00130  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase, putative  43.57 
 
 
764 aa  194  8e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0303135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  38.22 
 
 
302 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48416  predicted protein  37.2 
 
 
511 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.95 
 
 
488 aa  126  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.01 
 
 
474 aa  124  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  40 
 
 
485 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40.93 
 
 
314 aa  118  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.07 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2455  Fmu (Sun) domain protein  40.61 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.17 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.38 
 
 
470 aa  111  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36 
 
 
325 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.52 
 
 
471 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.56 
 
 
301 aa  107  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.33 
 
 
455 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.36 
 
 
302 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.71 
 
 
454 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.5 
 
 
302 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.17 
 
 
454 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3109  Fmu (Sun) domain protein  40.41 
 
 
414 aa  104  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  32.7 
 
 
788 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  34.36 
 
 
460 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  38.1 
 
 
513 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  38.1 
 
 
513 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.57 
 
 
480 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  32.35 
 
 
479 aa  101  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  37.71 
 
 
625 aa  101  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.61 
 
 
455 aa  101  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.57 
 
 
513 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.57 
 
 
479 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.57 
 
 
479 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  36.68 
 
 
695 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  35 
 
 
462 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.36 
 
 
302 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  35.29 
 
 
460 aa  99  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1457  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.57 
 
 
335 aa  97.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  36.51 
 
 
479 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.51 
 
 
481 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.35 
 
 
321 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.51 
 
 
481 aa  96.3  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  36.51 
 
 
479 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.42 
 
 
478 aa  96.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.51 
 
 
481 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  36.93 
 
 
478 aa  95.9  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.51 
 
 
481 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.63 
 
 
486 aa  95.1  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  37.06 
 
 
444 aa  95.5  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.98 
 
 
479 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.57 
 
 
478 aa  95.1  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.81 
 
 
458 aa  95.1  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  39.74 
 
 
436 aa  95.1  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.69 
 
 
339 aa  94.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.63 
 
 
444 aa  94.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.98 
 
 
481 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.98 
 
 
481 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.36 
 
 
501 aa  94.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.97 
 
 
474 aa  94.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.94 
 
 
444 aa  92.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.48 
 
 
438 aa  92.4  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.57 
 
 
481 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  37.21 
 
 
444 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.93 
 
 
503 aa  91.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.98 
 
 
467 aa  91.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  32.76 
 
 
336 aa  91.3  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.97 
 
 
510 aa  90.9  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1541  RNA methylase  34.05 
 
 
275 aa  90.9  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.39 
 
 
473 aa  90.9  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.84 
 
 
305 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  34.64 
 
 
447 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  30.27 
 
 
428 aa  90.5  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.51 
 
 
505 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35 
 
 
505 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.43 
 
 
510 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.04 
 
 
505 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0122  NOL1/NOP2/sun family protein  38.38 
 
 
429 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  35.98 
 
 
457 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  36.22 
 
 
449 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.83 
 
 
488 aa  90.1  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.51 
 
 
505 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.51 
 
 
505 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.43 
 
 
509 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  37.22 
 
 
444 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  37.22 
 
 
444 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  37.22 
 
 
444 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.51 
 
 
505 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2026  Fmu (Sun) domain protein  34.91 
 
 
447 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1514  NusB/RsmB/TIM44  32.84 
 
 
416 aa  88.2  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  36.42 
 
 
444 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.39 
 
 
482 aa  88.6  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  29.72 
 
 
436 aa  88.2  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.16 
 
 
503 aa  88.2  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  31.11 
 
 
435 aa  87.4  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  34.34 
 
 
452 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>