264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46448 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46448  predicted protein  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46447  predicted protein  42.42 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35158  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860566  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36981  heat shock protein Hsp20  34.92 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
141 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
164 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
153 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
136 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
150 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
147 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
147 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1099  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
141 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000114288  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54656  HSP20  29.19 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.222487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
164 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1100  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
140 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000787218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
150 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
166 aa  55.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
169 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.39 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.67 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  30.08 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  26.67 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
147 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
145 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.41 
 
 
151 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
139 aa  53.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  29.41 
 
 
151 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
143 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 
148 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
143 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  29.63 
 
 
152 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  28.7 
 
 
158 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
155 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
145 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
180 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 
145 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
144 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
143 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.3 
 
 
147 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
141 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
167 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 
164 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  27.2 
 
 
158 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
146 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  27.18 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  29.52 
 
 
153 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
151 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  27.72 
 
 
176 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
144 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
148 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  27.87 
 
 
132 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
145 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.28 
 
 
162 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  30.28 
 
 
162 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0504  heat shock protein Hsp20  26.35 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.5396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
146 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
149 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
173 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 
147 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 
189 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  28.04 
 
 
135 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  25.34 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
139 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  30.51 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
152 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
152 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.23 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.08 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  30.85 
 
 
129 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  28.18 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>