More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1622 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 898 aa  1857    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.02 
 
 		 697 aa  650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  47.95 
 
 		 914 aa  798    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  49.28 
 
 		 897 aa  793    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  48.56 
 
 		 832 aa  794    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.98 
 
 		 904 aa  782    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  49.33 
 
 		 977 aa  770    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  51.73 
 
 		 864 aa  806    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  53.02 
 
 		 906 aa  829    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  47.93 
 
 		 859 aa  787    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  49.23 
 
 		 846 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.98 
 
 		 708 aa  622  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  36.79 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  37.15 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  40.33 
 
 		 490 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  30.75 
 
 		 848 aa  194  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.29 
 
 		 922 aa  192  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0234  DNA gyrase subunit A  32.22 
 
 		 898 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0858  DNA gyrase subunit A  32.33 
 
 		 898 aa  191  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.683478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  35.96 
 
 		 923 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  31.34 
 
 		 900 aa  189  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.01 
 
 		 934 aa  189  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  34.97 
 
 		 806 aa  188  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  35.79 
 
 		 814 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  33.98 
 
 		 869 aa  187  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.47 
 
 		 828 aa  187  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.698383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1170  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.67 
 
 		 793 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000163791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0553  DNA topoisomerase IV subunit A  31.94 
 
 		 775 aa  187  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2546  DNA topoisomerase IV subunit A  32.81 
 
 		 747 aa  187  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  33.05 
 
 		 898 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 		 928 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4563  DNA gyrase subunit A  30.78 
 
 		 936 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2131  DNA topoisomerase IV subunit A  36.36 
 
 		 831 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 919 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 921 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 923 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4181  DNA gyrase, A subunit  34 
 
 		 911 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  31.45 
 
 		 809 aa  184  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  33.89 
 
 		 904 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  32.99 
 
 		 929 aa  184  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  35.44 
 
 		 745 aa  184  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 893 aa  184  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1241  DNA gyrase subunit A  32.83 
 
 		 931 aa  184  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.998227  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2386  DNA gyrase subunit A  30 
 
 		 930 aa  184  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380796  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 893 aa  183  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  33.83 
 
 		 914 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 922 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003111  DNA gyrase subunit A  30.42 
 
 		 906 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00046231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  34.63 
 
 		 835 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  31.26 
 
 		 870 aa  183  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  29.64 
 
 		 848 aa  183  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  33.06 
 
 		 923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  31.14 
 
 		 818 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  34.83 
 
 		 809 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1930  DNA gyrase subunit A  31.46 
 
 		 945 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  36.18 
 
 		 856 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  32.96 
 
 		 921 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  29.78 
 
 		 908 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  31.53 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  30.64 
 
 		 815 aa  181  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  32.84 
 
 		 809 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  31.57 
 
 		 811 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1961  DNA gyrase subunit A  32.96 
 
 		 921 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.844346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2151  DNA gyrase, A subunit  29.47 
 
 		 910 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  31.61 
 
 		 882 aa  181  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  32.24 
 
 		 878 aa  181  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4493  DNA gyrase, A subunit  32.05 
 
 		 891 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0318161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  31.97 
 
 		 894 aa  181  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1621  DNA topoisomerase IV subunit A  33.33 
 
 		 836 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000739384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  30.37 
 
 		 838 aa  180  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  30.78 
 
 		 827 aa  180  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  30.64 
 
 		 881 aa  180  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  31.61 
 
 		 927 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  33.08 
 
 		 911 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1417  DNA topoisomerase IV subunit A  32.89 
 
 		 828 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.121142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  34.97 
 
 		 913 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  32.51 
 
 		 910 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  32.88 
 
 		 862 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  33.08 
 
 		 911 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1422  DNA topoisomerase IV subunit A  31.56 
 
 		 813 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1744  DNA gyrase subunit A  31.24 
 
 		 941 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494976  normal  0.4202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  33.61 
 
 		 853 aa  179  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  32.15 
 
 		 877 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2551  DNA topoisomerase IV subunit A  33.87 
 
 		 767 aa  179  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  33.15 
 
 		 880 aa  179  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  31.34 
 
 		 897 aa  178  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  28.97 
 
 		 821 aa  178  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  31.34 
 
 		 885 aa  178  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  33.96 
 
 		 829 aa  178  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  32.97 
 
 		 902 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  31.34 
 
 		 897 aa  178  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  33.63 
 
 		 915 aa  178  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2084  DNA gyrase, A subunit  34.23 
 
 		 812 aa  178  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  33.59 
 
 		 913 aa  177  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  32.69 
 
 		 907 aa  177  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  33.25 
 
 		 913 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0329  DNA topoisomerase IV subunit A  33.6 
 
 		 767 aa  177  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.361131  normal  0.819437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1620  DNA gyrase subunit A  33.98 
 
 		 881 aa  177  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  32.97 
 
 		 864 aa  177  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1124  DNA topoisomerase IV subunit A  36.76 
 
 		 750 aa  177  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>