96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0980 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1529    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  27.96 
 
 		 766 aa  255  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  27.22 
 
 		 851 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  26.85 
 
 		 769 aa  231  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 810 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  27.58 
 
 		 762 aa  222  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 772 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  28.97 
 
 		 808 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  27.68 
 
 		 767 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  26.48 
 
 		 775 aa  214  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  24.45 
 
 		 858 aa  213  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  25 
 
 		 809 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  26.63 
 
 		 875 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  26.27 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  24.23 
 
 		 780 aa  172  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  22.66 
 
 		 853 aa  170  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  23.36 
 
 		 803 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  25.68 
 
 		 761 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  27.11 
 
 		 722 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 730 aa  108  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  26 
 
 		 743 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 734 aa  97.4  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  30.2 
 
 		 741 aa  91.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  24.81 
 
 		 725 aa  91.3  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.26 
 
 		 787 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.26 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.17 
 
 		 799 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.81 
 
 		 772 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 610 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.53 
 
 		 665 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.46 
 
 		 752 aa  52  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2687  surface antigen (D15)  36.36 
 
 		 617 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  43.06 
 
 		 573 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2436  surface antigen (D15)  34.52 
 
 		 608 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0843577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  27.92 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  32.3 
 
 		 583 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  32.05 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  26.91 
 
 		 702 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  40 
 
 		 596 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  30.6 
 
 		 786 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 580 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  34.88 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.39 
 
 		 758 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  34.88 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  36.46 
 
 		 583 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  31.62 
 
 		 575 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  37.5 
 
 		 636 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 683 aa  47.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.27 
 
 		 765 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.79 
 
 		 769 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  37.38 
 
 		 791 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  33.55 
 
 		 582 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.5 
 
 		 790 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.74 
 
 		 787 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  37.36 
 
 		 609 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04024  surface antigen D15  37.5 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  29.06 
 
 		 576 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  43.75 
 
 		 786 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  29.09 
 
 		 652 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.96 
 
 		 784 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  33.72 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  43.75 
 
 		 786 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  32.31 
 
 		 796 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  35 
 
 		 613 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  29.45 
 
 		 677 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  33.04 
 
 		 575 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  29.45 
 
 		 677 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  36 
 
 		 794 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  28.95 
 
 		 1126 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  39.19 
 
 		 633 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  35.44 
 
 		 618 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  37.33 
 
 		 555 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  37.97 
 
 		 617 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  36.36 
 
 		 766 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  37.97 
 
 		 617 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  37.97 
 
 		 617 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  37.97 
 
 		 617 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1045 aa  45.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  50 
 
 		 795 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  34.52 
 
 		 596 aa  44.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 595 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  30.71 
 
 		 661 aa  44.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.91 
 
 		 769 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  30.39 
 
 		 776 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  30.97 
 
 		 573 aa  44.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  34.18 
 
 		 591 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  34.18 
 
 		 591 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  30.71 
 
 		 661 aa  44.3  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  30.71 
 
 		 661 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1894  surface antigen (D15)  34.18 
 
 		 591 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  35.42 
 
 		 781 aa  44.3  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  29.37 
 
 		 657 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>