More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3031 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
377 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  41.39 
 
 
362 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  37.6 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  37.03 
 
 
353 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  35.26 
 
 
390 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  36.56 
 
 
363 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  40.58 
 
 
390 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  37.99 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  38.49 
 
 
387 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  36.07 
 
 
397 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  39.34 
 
 
354 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  35.11 
 
 
365 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  35.53 
 
 
373 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  32.35 
 
 
367 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 
350 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 
364 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  31.74 
 
 
358 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 
360 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 
360 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  33.21 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  31 
 
 
361 aa  126  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 
384 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  31.75 
 
 
348 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  34.73 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.45 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  28.61 
 
 
356 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
373 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  31.69 
 
 
363 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 
349 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  30.98 
 
 
361 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.88 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.68 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.94 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.3 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
529 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.33 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 
438 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  27.96 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.57 
 
 
349 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.67 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.67 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.33 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.33 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.33 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.33 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.33 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 
348 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.1 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.32 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  25.58 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.19 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  30.17 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.47 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  30.13 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2011  hypothetical protein  45.05 
 
 
99 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  21.74 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  23.75 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.55 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.55 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.55 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.3 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.55 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.92 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.55 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.37 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  30.34 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.45 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  25.95 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.48 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.48 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.59 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  25.66 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.59 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.61 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.61 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.61 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.61 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.45 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.26 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.26 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.26 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.2 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.26 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  24.29 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  24.03 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.02 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.26 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.68 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.85 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>