113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2202 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 169 aa  344  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  82.84 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  82.84 
 
 		 169 aa  299  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  76.92 
 
 		 169 aa  280  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  74.56 
 
 		 169 aa  257  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  70.41 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  69.28 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  68.67 
 
 		 169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.97 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.39 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  53.89 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  53.89 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  52.69 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  52.69 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  57.64 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  55.94 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  56.25 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  50.9 
 
 		 161 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  56.94 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  56.25 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  44.08 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  41.67 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  47.06 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  42.28 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  43.71 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  44.3 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  44.85 
 
 		 172 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  44.85 
 
 		 172 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  43.66 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  43.66 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  43.06 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  42.48 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  43.14 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  36.71 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  39.57 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  37.82 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  35.9 
 
 		 161 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  37.82 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  37.18 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  40.28 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  40.28 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  43.7 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  35.62 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  40.79 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  39.47 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  38.18 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  38.12 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  36.65 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  38.82 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  40.28 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  36.9 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  34.57 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  35.4 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  40.74 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  40 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  36.03 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  37.12 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  37.12 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  43.59 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  31.06 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  34.03 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  33.33 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  34.56 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  31.06 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  37.31 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  31.68 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  31.62 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  30.43 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  27.94 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  28.46 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  25.56 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  30.43 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  31.2 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  26.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  30.91 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  30.77 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  27.54 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.91 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  29.63 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  22.89 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  25.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  29.71 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.63 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.26 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  25 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  27.41 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.55 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  25 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  26.81 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  24.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  24.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  23.49 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  23.12 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  23.49 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  26.5 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  37.96 
 
 		 705 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  26.43 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  24.79 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  25.88 
 
 		 1100 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>