More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1019 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 238 aa  483  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  86.5 
 
 		 238 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  86.5 
 
 		 238 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  80.25 
 
 		 238 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  78.15 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  78.15 
 
 		 238 aa  388  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  79.15 
 
 		 237 aa  384  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0264  50S ribosomal protein L1  77.31 
 
 		 238 aa  367  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0248875  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 244 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 235 aa  344  6e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  65.52 
 
 		 235 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  65.52 
 
 		 235 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 		 235 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  65.52 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 235 aa  331  5e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  65.09 
 
 		 235 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2155  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  56.64 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  55.79 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12802  Plastid ribosomal protein L1 large ribosomal subunit  63.86 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.397521  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.27 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  53.19 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.81 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.81 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  53.74 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.81 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  49.15 
 
 		 234 aa  244  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  49.78 
 
 		 235 aa  244  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  55.9 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  52.14 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  49.35 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  48.23 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 231 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  52.56 
 
 		 234 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  46.75 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  46.75 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  46.75 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  46.52 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  47.83 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  52.45 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  53.25 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  47.21 
 
 		 238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  46.9 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  49.12 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  51.1 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  50 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 232 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>