More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0501 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 376 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  57.67 
 
 		 373 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  52.96 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  55.29 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  54.18 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  54.67 
 
 		 374 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  47.07 
 
 		 376 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  35.6 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  35.6 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  33.69 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  33.42 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  31.35 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  32.08 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  32.7 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  33.69 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  34.2 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  31.52 
 
 		 375 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  33.03 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.95 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.31 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 424 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.19 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.16 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.88 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.54 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 		 430 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.44 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  26.42 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  25.89 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.7 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.87 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.38 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.94 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.53 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>