144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3906 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  61.78 
 
 		 637 aa  761    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 633 aa  1311    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  49.83 
 
 		 610 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.88 
 
 		 655 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  30.63 
 
 		 655 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  28.6 
 
 		 588 aa  223  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  29.08 
 
 		 580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  28.88 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.65 
 
 		 653 aa  145  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.06 
 
 		 575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.46 
 
 		 575 aa  137  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  26.41 
 
 		 610 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.75 
 
 		 610 aa  133  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.75 
 
 		 610 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.75 
 
 		 610 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.75 
 
 		 612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.39 
 
 		 612 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.14 
 
 		 612 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.2 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  26.19 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.64 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.88 
 
 		 656 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.88 
 
 		 656 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  25.47 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  31.31 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.62 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  25.4 
 
 		 585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  25.4 
 
 		 585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  26.68 
 
 		 601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  26.59 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.57 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  25.54 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.61 
 
 		 1153 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.69 
 
 		 580 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.19 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.53 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.32 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.32 
 
 		 592 aa  108  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  29.38 
 
 		 582 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  26.65 
 
 		 594 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.23 
 
 		 991 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.95 
 
 		 577 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.44 
 
 		 582 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.44 
 
 		 582 aa  107  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 582 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  24.39 
 
 		 597 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.53 
 
 		 580 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  26.02 
 
 		 601 aa  104  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 		 631 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  24.95 
 
 		 998 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 		 642 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  24.95 
 
 		 998 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 613 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  25.39 
 
 		 629 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  27.76 
 
 		 799 aa  98.2  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  26.41 
 
 		 637 aa  98.2  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  27.04 
 
 		 625 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.41 
 
 		 617 aa  97.4  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  24.81 
 
 		 577 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  24.48 
 
 		 639 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.57 
 
 		 585 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  23.89 
 
 		 562 aa  94  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  23.19 
 
 		 642 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  24.55 
 
 		 621 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  23.62 
 
 		 813 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  26.33 
 
 		 635 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  25.99 
 
 		 602 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  24.15 
 
 		 1148 aa  90.5  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  26.91 
 
 		 842 aa  90.5  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  23.38 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.09 
 
 		 604 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  25.77 
 
 		 602 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  24.81 
 
 		 627 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  29.29 
 
 		 592 aa  87.4  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  25.32 
 
 		 596 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.11 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  23.9 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.21 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  23.78 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.53 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.55 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  24.84 
 
 		 599 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  23.6 
 
 		 819 aa  81.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  28.62 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  21.88 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  21.88 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  24.85 
 
 		 600 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  30.53 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.3 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.69 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  21.74 
 
 		 608 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.41 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  27.15 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>