More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2968 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  50.44 
 
 		 1040 aa  920    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  79.59 
 
 		 1025 aa  1625    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  79.59 
 
 		 1025 aa  1625    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1040 aa  919    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.58 
 
 		 1032 aa  880    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  49.02 
 
 		 1036 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  56.13 
 
 		 1035 aa  1081    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  80.53 
 
 		 1025 aa  1628    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  50.63 
 
 		 1041 aa  968    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  65.55 
 
 		 1033 aa  1308    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  871    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.19 
 
 		 1034 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.54 
 
 		 1035 aa  1096    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  870    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  48.14 
 
 		 1034 aa  844    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  50.53 
 
 		 1036 aa  909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  56.71 
 
 		 1035 aa  1102    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  47.07 
 
 		 1029 aa  886    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  64.26 
 
 		 1103 aa  968    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1046 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  44.75 
 
 		 1065 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  41.77 
 
 		 1023 aa  694    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  51.38 
 
 		 1044 aa  931    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  49.31 
 
 		 1032 aa  946    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  50.59 
 
 		 1040 aa  929    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1499  multidrug resistance protein mdtC  58.29 
 
 		 1100 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.02 
 
 		 1036 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.29 
 
 		 1048 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  51.65 
 
 		 1034 aa  952    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  57.57 
 
 		 1035 aa  1126    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  47.54 
 
 		 1033 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  59.07 
 
 		 1102 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  48.74 
 
 		 1037 aa  873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  46.66 
 
 		 1037 aa  882    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1029 aa  860    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.35 
 
 		 1048 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.02 
 
 		 1036 aa  902    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.68 
 
 		 1100 aa  863    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  44.35 
 
 		 1041 aa  783    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  45.72 
 
 		 1042 aa  889    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  49.51 
 
 		 1037 aa  939    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 		 1038 aa  912    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  46.07 
 
 		 1024 aa  843    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  46.71 
 
 		 1041 aa  905    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 1042 aa  905    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 		 1034 aa  956    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 		 1044 aa  940    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  58.24 
 
 		 1051 aa  1078    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  46.84 
 
 		 1028 aa  840    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  46.94 
 
 		 1052 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  53.94 
 
 		 1107 aa  1096    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  48.48 
 
 		 1040 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2909  multidrug efflux system protein  59.43 
 
 		 1103 aa  894    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.19 
 
 		 1041 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2010  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  49.31 
 
 		 1106 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  49.46 
 
 		 1041 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  49.02 
 
 		 1037 aa  911    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1042 aa  929    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  52.96 
 
 		 1037 aa  964    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  48.27 
 
 		 1042 aa  846    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1048 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  48.28 
 
 		 1032 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1042 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  61.25 
 
 		 1096 aa  888    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1037 aa  900    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  59.42 
 
 		 1100 aa  1220    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  50.88 
 
 		 1051 aa  946    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1066 aa  920    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  45.11 
 
 		 1069 aa  860    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  47.5 
 
 		 1092 aa  920    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  55.71 
 
 		 1032 aa  1068    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0717  acriflavin resistance protein  58.03 
 
 		 1102 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 		 1039 aa  898    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1362  multidrug resistance protein MdtC  58.29 
 
 		 1100 aa  857    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  49.66 
 
 		 1040 aa  955    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  872    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  49.02 
 
 		 1036 aa  909    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  44.46 
 
 		 1032 aa  824    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1078  acriflavin resistance protein  58.65 
 
 		 1102 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.955454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  48.87 
 
 		 1039 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  51.08 
 
 		 1043 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  62.17 
 
 		 1036 aa  1157    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  48.84 
 
 		 1036 aa  891    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1196  acriflavin resistance protein  58.16 
 
 		 1102 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.458181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 		 1039 aa  898    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  48.05 
 
 		 1055 aa  938    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1367  multidrug resistance protein MdtC  58.29 
 
 		 1100 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  51.86 
 
 		 1029 aa  962    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  60.31 
 
 		 1036 aa  1139    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  59.8 
 
 		 1034 aa  1126    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  47.81 
 
 		 1041 aa  907    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  55.68 
 
 		 1043 aa  1076    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  55.23 
 
 		 1070 aa  1023    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  45.79 
 
 		 1108 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  55.85 
 
 		 1072 aa  1109    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.2 
 
 		 1048 aa  870    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  51.02 
 
 		 1051 aa  975    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  47.06 
 
 		 1026 aa  790    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>