82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0807 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  91.17 
 
 		 453 aa  847    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  923    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  66.52 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  62.69 
 
 		 457 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  61.47 
 
 		 451 aa  541  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  59.72 
 
 		 451 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  34.86 
 
 		 699 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  32.02 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  33.24 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  32.57 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.85 
 
 		 512 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  30.94 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  29.89 
 
 		 998 aa  140  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  29.25 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  31.35 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  31.62 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  30.29 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  31.44 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  31.17 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.98 
 
 		 1844 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  28.2 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.09 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  30.03 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.46 
 
 		 1175 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  28.97 
 
 		 2852 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  27.96 
 
 		 945 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.76 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.39 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.42 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.48 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 3977 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30.56 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  28.24 
 
 		 733 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  29.48 
 
 		 719 aa  63.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  27.5 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  26.17 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.87 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 1016 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  30.17 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.96 
 
 		 854 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.74 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.64 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  25.77 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  25.77 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.27 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  24.89 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.93 
 
 		 731 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  28.28 
 
 		 760 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  28.71 
 
 		 721 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.16 
 
 		 769 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.83 
 
 		 729 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  27.09 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  29.63 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  26.1 
 
 		 754 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  26.03 
 
 		 451 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  21.88 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  26.1 
 
 		 754 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  28.15 
 
 		 723 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.69 
 
 		 720 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  24.09 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  21.48 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  27.33 
 
 		 723 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.4 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  24.37 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.08 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  28.22 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  22.83 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  27.89 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  24.83 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.06 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  24.83 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  24.82 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  24.83 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.34 
 
 		 1027 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  30.95 
 
 		 732 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  28.22 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  25.08 
 
 		 793 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  24.46 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>