104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  100 
 
 		 389 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  94.97 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  42.97 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  36.6 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  34.96 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  37.91 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  34.1 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  37.82 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  36.68 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  34.93 
 
 		 409 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  38.17 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 408 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  33.42 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  35.69 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  32.29 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  32.67 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  31.66 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  30.34 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  28.88 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  28.23 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 408 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  29.48 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  30.2 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  26.89 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.07 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  27.1 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  27.1 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.95 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  24.48 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  28.34 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  28.73 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.3 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  27.8 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  23.91 
 
 		 421 aa  46.2  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 525 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>