More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31240 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  100 
 
 		 436 aa  854    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  86.44 
 
 		 436 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  70.48 
 
 		 440 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  65.45 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  64.76 
 
 		 440 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  67.27 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  64.91 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  61.14 
 
 		 441 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  66.89 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  65.23 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  64.77 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  62.28 
 
 		 408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  57.79 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  55.14 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  59.33 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 464 aa  329  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  43 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  49.14 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  45.6 
 
 		 307 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  21.8 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  31.49 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  25.95 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  33.51 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.32 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.32 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.24 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.9 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.08 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.34 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.83 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.83 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.83 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.34 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.68 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  27.51 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.7 
 
 		 1833 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.88 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.58 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.91 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.96 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.67 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.53 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.53 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  28.88 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  28.88 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  28.88 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.53 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  28.88 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  22.74 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.53 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  26.86 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  23.91 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.91 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.13 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>