212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  69.03 
 
 
788 aa  1073    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  68.77 
 
 
787 aa  1073    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  67.97 
 
 
795 aa  1144    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  67.84 
 
 
795 aa  1139    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  70.88 
 
 
803 aa  1177    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  64.71 
 
 
809 aa  1075    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1607    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  69.56 
 
 
787 aa  1068    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  96.48 
 
 
795 aa  1540    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  70.28 
 
 
792 aa  1141    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  68.55 
 
 
788 aa  1090    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  38.1 
 
 
795 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.8 
 
 
821 aa  343  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  32.72 
 
 
821 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.03 
 
 
817 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  32.25 
 
 
827 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  32.45 
 
 
827 aa  330  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  33.47 
 
 
769 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.44 
 
 
829 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.08 
 
 
789 aa  304  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  31.21 
 
 
843 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.55 
 
 
796 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.55 
 
 
796 aa  293  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.55 
 
 
796 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.55 
 
 
796 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.54 
 
 
796 aa  292  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  29.06 
 
 
796 aa  290  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.98 
 
 
796 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.86 
 
 
819 aa  290  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.31 
 
 
796 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  30.73 
 
 
854 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.43 
 
 
796 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.52 
 
 
787 aa  285  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.75 
 
 
855 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.11 
 
 
796 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  30.66 
 
 
810 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.67 
 
 
783 aa  282  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  29.02 
 
 
804 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.76 
 
 
870 aa  280  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.51 
 
 
803 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  30.52 
 
 
818 aa  277  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.85 
 
 
819 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  31.89 
 
 
836 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28.7 
 
 
903 aa  273  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 
844 aa  270  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  30.65 
 
 
813 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  29.67 
 
 
779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.95 
 
 
770 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.35 
 
 
829 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.88 
 
 
807 aa  263  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  30.3 
 
 
857 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  31.24 
 
 
854 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  28.18 
 
 
848 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  28.38 
 
 
823 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.38 
 
 
823 aa  254  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  27.8 
 
 
847 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  28.55 
 
 
847 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  29.62 
 
 
816 aa  251  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  29.27 
 
 
827 aa  251  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.8 
 
 
826 aa  251  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.65 
 
 
809 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.16 
 
 
809 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.74 
 
 
818 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.51 
 
 
821 aa  247  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.43 
 
 
812 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.36 
 
 
811 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.39 
 
 
839 aa  245  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  28.08 
 
 
837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  30.24 
 
 
847 aa  242  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.1 
 
 
856 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29 
 
 
774 aa  237  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.04 
 
 
824 aa  237  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  29.03 
 
 
782 aa  237  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.33 
 
 
823 aa  234  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.11 
 
 
822 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.61 
 
 
889 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.62 
 
 
808 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  29.69 
 
 
872 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  27.17 
 
 
824 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  28.31 
 
 
837 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  28.12 
 
 
837 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  28.31 
 
 
837 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  28.5 
 
 
833 aa  228  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  28.31 
 
 
823 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.88 
 
 
864 aa  228  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  28.18 
 
 
837 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  28.18 
 
 
837 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  28.18 
 
 
837 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.42 
 
 
780 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.26 
 
 
809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.26 
 
 
809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.38 
 
 
806 aa  220  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.79 
 
 
807 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.95 
 
 
821 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.04 
 
 
858 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  31.12 
 
 
898 aa  204  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  27.93 
 
 
785 aa  194  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  27.33 
 
 
818 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  28.69 
 
 
906 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  26.35 
 
 
841 aa  189  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>