More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21391  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 621 aa  1244    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1737  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.29 
 
 		 657 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.524932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04541  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.97 
 
 		 657 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0660  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.58 
 
 		 645 aa  888    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2011  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.14 
 
 		 637 aa  894    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04001  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.19 
 
 		 664 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04221  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.54 
 
 		 647 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04531  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.71 
 
 		 647 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0398  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.68 
 
 		 647 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04641  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.71 
 
 		 641 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0522335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3173  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 		 658 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  44.83 
 
 		 684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  45.09 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0918  long-chain-fatty-acid CoA ligase  46.35 
 
 		 649 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  45.09 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 657 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 		 661 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 		 638 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 625 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12420  predicted protein  37.38 
 
 		 633 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 630 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 629 aa  306  7e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0606  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.15 
 
 		 645 aa  301  2e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.969184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1742  AMP-binding enzyme family protein  31.9 
 
 		 641 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 629 aa  286  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 607 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.51 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.66 
 
 		 610 aa  274  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 633 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 610 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0137  long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.02 
 
 		 630 aa  270  5e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 652 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 637 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 672 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.47 
 
 		 597 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 604 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 603 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 604 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 601 aa  244  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 669 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 685 aa  243  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 605 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 605 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 597 aa  237  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.55 
 
 		 587 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 612 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 605 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 597 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 620 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 660 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.71 
 
 		 614 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 601 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 612 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 597 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  31.49 
 
 		 597 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 		 602 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 592 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 591 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 603 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 603 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 597 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 604 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 607 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 660 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.83 
 
 		 602 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 607 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 599 aa  223  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.12 
 
 		 602 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  28.57 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 601 aa  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 647 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 605 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.81 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 599 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 599 aa  218  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>