More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  76.51 
 
 
371 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  65.77 
 
 
367 aa  217  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  71.14 
 
 
355 aa  217  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  65.1 
 
 
367 aa  216  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  63.09 
 
 
386 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  67.79 
 
 
371 aa  212  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.7 
 
 
369 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.7 
 
 
369 aa  183  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.03 
 
 
369 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  54.36 
 
 
367 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  48.99 
 
 
379 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  49.34 
 
 
652 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  45.81 
 
 
367 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  47.02 
 
 
652 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  48.03 
 
 
360 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  44.74 
 
 
666 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  44.08 
 
 
666 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  44.94 
 
 
684 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  43.33 
 
 
1033 aa  114  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  39.07 
 
 
365 aa  103  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  44.03 
 
 
373 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  38.28 
 
 
371 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  44.93 
 
 
382 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  40.77 
 
 
376 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  43.08 
 
 
401 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  46.46 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  45.11 
 
 
392 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  39.84 
 
 
363 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  36.69 
 
 
367 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  43.88 
 
 
385 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  35.66 
 
 
367 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  40 
 
 
375 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  40.14 
 
 
368 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  38.76 
 
 
404 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 
367 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  38.31 
 
 
398 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  36.64 
 
 
364 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
366 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
365 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  42.97 
 
 
375 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  37.66 
 
 
385 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.1 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  39.68 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  39.68 
 
 
440 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  35.82 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
365 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  37.59 
 
 
388 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  40.44 
 
 
374 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
365 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
376 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  35.16 
 
 
375 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  41.48 
 
 
410 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  40.77 
 
 
376 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  40.77 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  38.46 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  36.92 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  38.93 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  39.53 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  37.21 
 
 
361 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  38.71 
 
 
349 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  40 
 
 
402 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32.33 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  38.58 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  32.82 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  38.79 
 
 
406 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  34.43 
 
 
368 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  40.8 
 
 
389 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  36.22 
 
 
375 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
378 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  38.64 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  41.33 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 
419 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
393 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.27 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.27 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.27 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.27 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  39.01 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  34.09 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
369 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  37.12 
 
 
371 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
369 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  33.08 
 
 
377 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  31.3 
 
 
372 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
348 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  33.61 
 
 
417 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.33 
 
 
360 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.47 
 
 
417 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 
454 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  32.73 
 
 
388 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  34.62 
 
 
335 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  31.3 
 
 
361 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.48 
 
 
369 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>