More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12091 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  100 
 
 
567 aa  1118    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12081  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  95.24 
 
 
567 aa  1019    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0649311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1113  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  91.71 
 
 
566 aa  984    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.327644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  67.9 
 
 
563 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  35.4 
 
 
574 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.09 
 
 
573 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  32.65 
 
 
573 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.69 
 
 
576 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  27.46 
 
 
530 aa  258  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.4 
 
 
526 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.8 
 
 
599 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  25.52 
 
 
621 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.15 
 
 
650 aa  123  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.15 
 
 
646 aa  123  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  27.47 
 
 
734 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.35 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.54 
 
 
599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2767  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.89 
 
 
769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  26.34 
 
 
608 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  26.34 
 
 
608 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  26.39 
 
 
608 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.28 
 
 
608 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  26.28 
 
 
608 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  26.28 
 
 
608 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  26.28 
 
 
608 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  26.61 
 
 
608 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  26.13 
 
 
607 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  26.06 
 
 
608 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.61 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.79 
 
 
731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  24.02 
 
 
618 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  23.68 
 
 
619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1623  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.76 
 
 
679 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127673  normal  0.170261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.13 
 
 
594 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.93 
 
 
737 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4672  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.27 
 
 
691 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.15 
 
 
655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 
683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4536  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.05 
 
 
691 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636293  normal  0.640936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.32 
 
 
739 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  24.33 
 
 
611 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  24.33 
 
 
611 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  24.33 
 
 
611 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  24.33 
 
 
611 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  23.39 
 
 
611 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.21 
 
 
555 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4670  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.77 
 
 
691 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0281806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4850  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.61 
 
 
720 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.61173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.9 
 
 
742 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.04 
 
 
604 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0762  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.63 
 
 
691 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.089759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.3 
 
 
609 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0652  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.81 
 
 
610 aa  107  7e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.955738  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.03 
 
 
787 aa  106  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.25 
 
 
616 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  26.11 
 
 
706 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.53 
 
 
601 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.18 
 
 
601 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  25.27 
 
 
657 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.96 
 
 
698 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.87 
 
 
579 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  26.52 
 
 
725 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  23.8 
 
 
652 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.38 
 
 
721 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.45 
 
 
674 aa  103  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1987  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.72 
 
 
676 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000228018  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3006  exonuclease V subunit alpha  24.42 
 
 
616 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0805  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.18 
 
 
703 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.983579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.45 
 
 
551 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0690  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.5 
 
 
702 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  24.84 
 
 
657 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.6 
 
 
584 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2046  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.11 
 
 
739 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  27.17 
 
 
739 aa  100  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  24.43 
 
 
715 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2430  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.15 
 
 
647 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869931  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.93 
 
 
588 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2093  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.11 
 
 
740 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  27.48 
 
 
738 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.6 
 
 
581 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0010  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.86 
 
 
750 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2280  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 
739 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4566  hypothetical protein  25 
 
 
739 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  25.55 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.65 
 
 
639 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2643  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.95 
 
 
682 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108895  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0928  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.62 
 
 
674 aa  94  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.41 
 
 
580 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.41 
 
 
580 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.41 
 
 
580 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2112  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.84 
 
 
686 aa  93.6  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  26.24 
 
 
727 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2353  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.78 
 
 
767 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0547  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24 
 
 
619 aa  93.2  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.607405  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  24.82 
 
 
731 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.83 
 
 
687 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  25.29 
 
 
731 aa  92.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1269  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.15 
 
 
680 aa  92.8  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 
768 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.68 
 
 
740 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.615762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>