More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02781 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.43 
 
 		 207 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  70.94 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  70.79 
 
 		 206 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  54.4 
 
 		 210 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.5 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.5 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  55.17 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.78 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.26 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  207  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.45 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.15 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.5 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.67 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.76 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.3 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.62 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  44.97 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.97 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  40.93 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.1 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  40.41 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  36.97 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  35.58 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  37.14 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  39.42 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  48.25 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  39.35 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  36.82 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.63 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.67 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  39.42 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  34.36 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  37.82 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  36.68 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  35.84 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  40.62 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  44.35 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.61 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.22 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  30.14 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  37.34 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  36.78 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  41.22 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  34.38 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  39.06 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  39.06 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  45.61 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.41 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  41.48 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  41.48 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  41.48 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  36.59 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  42.97 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  31.4 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  35.91 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  36 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  41.98 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.46 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  46.09 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  46.09 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  39.26 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.16 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.48 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3549  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.08 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  35.11 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  39.69 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2131  isopropylmalate isomerase small subunit  35.54 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0284  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.57 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0044602  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  33.86 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  44.35 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  40.71 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  46.43 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  45.31 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  39.01 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1517  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.82 
 
 		 162 aa  92  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.292796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>