More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4563 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 496 aa  1035    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  47.07 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  46.64 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  48.58 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  48.53 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  45.98 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  45.75 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  45.37 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  42.99 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  44.91 
 
 		 425 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  45.03 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  44.77 
 
 		 470 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  43.09 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  42.92 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  43.82 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  40.33 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  41.48 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  42.31 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  28.3 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 390 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 405 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  22.87 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  25.39 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  22.65 
 
 		 421 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 385 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.25 
 
 		 393 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 347 aa  86.7  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  23.5 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  23.92 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.73 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.16 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  21.84 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 715 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  22.65 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.51 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.8 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.15 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  26.7 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  25.82 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  30.57 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.38 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  20.41 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>