More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3910 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 727 aa  1489    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  68.34 
 
 		 568 aa  665    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.41 
 
 		 568 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  51.92 
 
 		 871 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.86 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.67 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 885 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.67 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.33 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  43.21 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  53.08 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 888 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.43 
 
 		 568 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.68 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.02 
 
 		 557 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.75 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  40.6 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.82 
 
 		 555 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  52.43 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.27 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.11 
 
 		 568 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.04 
 
 		 568 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 642 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.65 
 
 		 568 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  38.32 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.73 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.86 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.03 
 
 		 553 aa  396  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.25 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.93 
 
 		 599 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 787 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.5 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.02 
 
 		 566 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 599 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  37.67 
 
 		 767 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 891 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.96 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.17 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  49.23 
 
 		 521 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  38.26 
 
 		 767 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  49.23 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  47.81 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  42.53 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  49.23 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  48.98 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  48.21 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.98 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.81 
 
 		 558 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  48.8 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  51.6 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 561 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  48.72 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  45.79 
 
 		 670 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.21 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 570 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  47.79 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  48.97 
 
 		 523 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.04 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.98 
 
 		 571 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  48.33 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 673 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  40.57 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.51 
 
 		 561 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  47.04 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 644 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  44.87 
 
 		 676 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.57 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.84 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  44.8 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  48.08 
 
 		 567 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  46.79 
 
 		 841 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  40.75 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.6 
 
 		 572 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 573 aa  366  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  49.36 
 
 		 569 aa  365  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  40.7 
 
 		 520 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.45 
 
 		 564 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.5 
 
 		 565 aa  364  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  47.95 
 
 		 569 aa  364  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  42.98 
 
 		 520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  44.57 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  48.34 
 
 		 566 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  47.32 
 
 		 638 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  41.93 
 
 		 573 aa  363  9e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>