236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3697 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3697    100 
 
 		 3918 bp  7767    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0387  methionine synthase  85.77 
 
 		 2718 bp  234  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723606  normal  0.0384626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6260  methionine synthase (B12-dependent)  84.23 
 
 		 2706 bp  204  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2303  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  84.23 
 
 		 2718 bp  204  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2917  methionine synthase  84.23 
 
 		 2718 bp  204  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2932  methionine synthase  84.23 
 
 		 2718 bp  204  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2966  methionine synthase  83.87 
 
 		 2718 bp  196  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4243  methionine synthase (B12-dependent)  83.94 
 
 		 2718 bp  194  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  83.45 
 
 		 2718 bp  190  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2829  methionine synthase  83.51 
 
 		 2718 bp  188  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  86.12 
 
 		 3747 bp  184  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  86.12 
 
 		 3744 bp  184  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  84.27 
 
 		 3738 bp  182  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  83.15 
 
 		 2718 bp  180  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0081    83.15 
 
 		 3843 bp  180  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  83.15 
 
 		 2718 bp  180  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  83.15 
 
 		 2718 bp  180  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  83.15 
 
 		 2718 bp  180  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  83.4 
 
 		 2718 bp  172  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  93.91 
 
 		 3753 bp  172  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  83.4 
 
 		 2718 bp  172  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  85.64 
 
 		 3786 bp  165  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0294  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  84.33 
 
 		 2718 bp  161  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  92.92 
 
 		 3753 bp  161  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3402  methionine synthase  94.23 
 
 		 2670 bp  159  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.131568  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0476  methionine synthase  82.62 
 
 		 2718 bp  153  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0559238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  82.95 
 
 		 3792 bp  151  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  94.74 
 
 		 3735 bp  149  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  91.82 
 
 		 3873 bp  147  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  91.82 
 
 		 3816 bp  147  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2403  methionine synthase  89.6 
 
 		 2685 bp  145  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362073  normal  0.0953455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  82.33 
 
 		 3687 bp  145  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0168  methionine synthase (B12-dependent)  83 
 
 		 2772 bp  145  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.616802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  92.31 
 
 		 3810 bp  143  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0117  methionine synthase  81.62 
 
 		 2820 bp  143  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  84.49 
 
 		 3915 bp  141  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  90.43 
 
 		 3753 bp  141  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3658  hypothetical protein  90.99 
 
 		 2703 bp  141  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0544622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  91.51 
 
 		 3882 bp  139  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  91.51 
 
 		 3864 bp  139  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  92.08 
 
 		 3753 bp  137  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  90.83 
 
 		 3882 bp  137  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0214  methionine synthase (B12-dependent)  81.23 
 
 		 2724 bp  137  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  81.07 
 
 		 2748 bp  135  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  90.65 
 
 		 3738 bp  133  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2399  methionine synthase (B12-dependent)  91.18 
 
 		 2709 bp  131  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0466  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  91.84 
 
 		 2898 bp  131  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0155  methionine synthase  81.3 
 
 		 2718 bp  131  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  91.09 
 
 		 3753 bp  129  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3270  methionine synthase  80.71 
 
 		 2775 bp  127  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  83.8 
 
 		 2685 bp  125  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2137  methionine synthase  90.29 
 
 		 3738 bp  125  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.39755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  82.83 
 
 		 3714 bp  123  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  82.5 
 
 		 3837 bp  119  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  91.3 
 
 		 3753 bp  119  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  87.1 
 
 		 3801 bp  119  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  90.53 
 
 		 3774 bp  117  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1848  methionine synthase (B12-dependent)  95.71 
 
 		 2730 bp  115  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  80.53 
 
 		 3723 bp  115  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  88.68 
 
 		 3699 bp  115  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  87.61 
 
 		 3705 bp  113  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  87.61 
 
 		 3705 bp  113  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  89.58 
 
 		 3774 bp  111  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  89.58 
 
 		 3774 bp  111  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  89.47 
 
 		 3732 bp  109  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  91.57 
 
 		 3678 bp  109  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  85.83 
 
 		 3795 bp  109  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  85.83 
 
 		 3663 bp  109  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  85.83 
 
 		 3795 bp  109  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  89.89 
 
 		 3684 bp  105  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  89.89 
 
 		 3663 bp  105  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  89.89 
 
 		 3684 bp  105  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  82.99 
 
 		 3861 bp  105  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0014  methionine synthase  80 
 
 		 2736 bp  105  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0171  methionine synthase  93.06 
 
 		 2751 bp  103  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  89.77 
 
 		 3684 bp  103  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0119  methionine synthase (B12-dependent)  79.64 
 
 		 2748 bp  103  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  87.5 
 
 		 3795 bp  103  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  89.77 
 
 		 3684 bp  103  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  89.01 
 
 		 3780 bp  101  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  79.92 
 
 		 3759 bp  101  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  85.04 
 
 		 3756 bp  101  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0147  methionine synthase (B12-dependent)  80.52 
 
 		 2739 bp  101  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.287887  normal  0.989958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  88.89 
 
 		 3684 bp  99.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  88.3 
 
 		 3708 bp  99.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  88.89 
 
 		 3687 bp  99.6  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  88.3 
 
 		 3708 bp  99.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  84.5 
 
 		 3714 bp  97.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  87.13 
 
 		 3711 bp  97.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1643  B12-dependent methionine synthase  90.91 
 
 		 3789 bp  97.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0494405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0147  methionine synthase  88.76 
 
 		 2718 bp  97.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  81 
 
 		 3681 bp  95.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  85.34 
 
 		 3774 bp  95.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01232  methionine synthase  84.87 
 
 		 2754 bp  93.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3346  methionine synthase (B12-dependent)  85.59 
 
 		 2727 bp  93.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  89.87 
 
 		 3711 bp  93.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0165  methionine synthase  80.15 
 
 		 2790 bp  93.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  87.23 
 
 		 3708 bp  91.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  89.02 
 
 		 3708 bp  91.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  86.73 
 
 		 3738 bp  91.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>