More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2399 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  60.67 
 
 		 1227 aa  1055    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  60.67 
 
 		 1227 aa  1054    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  59.84 
 
 		 905 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  59.29 
 
 		 1235 aa  1018    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  63.09 
 
 		 1237 aa  1082    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0294  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.19 
 
 		 905 aa  981    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  58.37 
 
 		 1230 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  60.9 
 
 		 1261 aa  1043    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59.53 
 
 		 1244 aa  1053    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  57.87 
 
 		 1239 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1244 aa  1055    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  61.43 
 
 		 1263 aa  1051    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  58.23 
 
 		 1234 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1239 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  55.37 
 
 		 1271 aa  959    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  60.92 
 
 		 1220 aa  1033    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  62.27 
 
 		 1257 aa  1054    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  59.37 
 
 		 1240 aa  1065    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0119  methionine synthase (B12-dependent)  57.34 
 
 		 915 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0147  methionine synthase (B12-dependent)  58.43 
 
 		 912 aa  976    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.287887  normal  0.989958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  59.65 
 
 		 1251 aa  1028    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  63.24 
 
 		 1237 aa  1065    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  62.81 
 
 		 1290 aa  1098    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  60.85 
 
 		 1261 aa  1044    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  59.96 
 
 		 905 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  58.48 
 
 		 1232 aa  1037    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  58.56 
 
 		 1236 aa  1017    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3346  methionine synthase (B12-dependent)  62.97 
 
 		 908 aa  1057    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2997  methionine synthase  62.86 
 
 		 908 aa  1057    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.199846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6260  methionine synthase (B12-dependent)  59.57 
 
 		 901 aa  998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1225 aa  1011    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3658  hypothetical protein  62.08 
 
 		 900 aa  1026    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0544622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  55.41 
 
 		 1224 aa  978    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  60.41 
 
 		 1244 aa  1052    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  59.96 
 
 		 905 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1233 aa  1057    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  58.91 
 
 		 1239 aa  1053    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  60.68 
 
 		 1245 aa  1031    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  61.38 
 
 		 1227 aa  1049    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  51.88 
 
 		 1252 aa  900    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  62.16 
 
 		 1287 aa  1076    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  59.57 
 
 		 1267 aa  1049    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  60.13 
 
 		 1264 aa  1040    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0014  methionine synthase  58.17 
 
 		 911 aa  957    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1979  methionine synthase  59.13 
 
 		 916 aa  978    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.96 
 
 		 905 aa  994    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2399  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 902 aa  1845    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  57.61 
 
 		 1259 aa  932    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  62.7 
 
 		 1304 aa  1082    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3206  methionine synthase (B12-dependent)  78.54 
 
 		 878 aa  1391    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0466  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  55.91 
 
 		 965 aa  979    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  59.93 
 
 		 1233 aa  1031    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  62.1 
 
 		 1286 aa  1070    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  59.15 
 
 		 1262 aa  1026    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0174  methionine synthase (B12-dependent)  57.38 
 
 		 944 aa  984    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4243  methionine synthase (B12-dependent)  58.62 
 
 		 905 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  59.84 
 
 		 1241 aa  1041    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  59.96 
 
 		 905 aa  1016    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  62.39 
 
 		 1228 aa  1077    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  62.93 
 
 		 1293 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  62.66 
 
 		 1245 aa  1078    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  61.69 
 
 		 1261 aa  1077    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  55.52 
 
 		 1271 aa  948    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  57.45 
 
 		 915 aa  997    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1848  methionine synthase (B12-dependent)  56.7 
 
 		 909 aa  955    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  61.4 
 
 		 1226 aa  1018    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  62.14 
 
 		 913 aa  1063    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  78.05 
 
 		 873 aa  1378    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2303  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.69 
 
 		 905 aa  1014    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  60.09 
 
 		 1220 aa  1040    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  61.43 
 
 		 1264 aa  1093    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1434  methionine synthase (B12-dependent)  59.09 
 
 		 897 aa  1021    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  59.82 
 
 		 1236 aa  1017    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1510  methionine synthase  57.45 
 
 		 891 aa  973    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  60.75 
 
 		 1244 aa  1068    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  60.75 
 
 		 1244 aa  1068    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  62.04 
 
 		 1245 aa  1070    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  59.35 
 
 		 1238 aa  1055    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  56.26 
 
 		 1272 aa  962    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2436  methionine synthase  61.45 
 
 		 885 aa  1033    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0619597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2966  methionine synthase  58.62 
 
 		 905 aa  985    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  58.34 
 
 		 1234 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  60.14 
 
 		 1226 aa  1047    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2917  methionine synthase  59.69 
 
 		 905 aa  1014    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  58.46 
 
 		 1220 aa  969    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  60.64 
 
 		 1244 aa  1066    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  59.29 
 
 		 1235 aa  1016    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.96 
 
 		 905 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  54.57 
 
 		 1249 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  62.49 
 
 		 1250 aa  1044    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  59.96 
 
 		 905 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  60.09 
 
 		 1244 aa  1011    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  59.31 
 
 		 1246 aa  1060    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  60.13 
 
 		 1264 aa  1040    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  56.54 
 
 		 1227 aa  980    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  59.52 
 
 		 1251 aa  1026    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  60.39 
 
 		 1232 aa  1064    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0168  methionine synthase (B12-dependent)  58.88 
 
 		 923 aa  976    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.616802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0214  methionine synthase (B12-dependent)  59.02 
 
 		 907 aa  1005    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0117  methionine synthase  57.42 
 
 		 939 aa  993    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0603491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>