More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2966 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  62.28 
 
 		 1227 aa  1102    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  62.28 
 
 		 1227 aa  1102    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  93.26 
 
 		 905 aa  1745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  63 
 
 		 1235 aa  1143    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  63.38 
 
 		 1237 aa  1157    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0294  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  84.75 
 
 		 905 aa  1580    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  61.02 
 
 		 1230 aa  1118    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  62.57 
 
 		 1261 aa  1130    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  61.01 
 
 		 1244 aa  1113    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  61.62 
 
 		 1239 aa  1108    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  60.24 
 
 		 1244 aa  1103    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  63.15 
 
 		 1263 aa  1141    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  63.9 
 
 		 1234 aa  1139    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  61.62 
 
 		 1239 aa  1094    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  56.08 
 
 		 1271 aa  996    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  65.12 
 
 		 1220 aa  1154    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  62.09 
 
 		 1257 aa  1119    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1240 aa  1111    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0119  methionine synthase (B12-dependent)  85.41 
 
 		 915 aa  1571    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  62.17 
 
 		 1228 aa  1145    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  93.26 
 
 		 905 aa  1745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  66.85 
 
 		 1237 aa  1210    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  61.74 
 
 		 1290 aa  1127    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  62.1 
 
 		 1226 aa  1121    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  93.26 
 
 		 905 aa  1745    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  61.24 
 
 		 1232 aa  1134    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  63.04 
 
 		 1236 aa  1115    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  62.1 
 
 		 1264 aa  1129    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3346  methionine synthase (B12-dependent)  61.63 
 
 		 908 aa  1095    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2997  methionine synthase  61.41 
 
 		 908 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.199846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6260  methionine synthase (B12-dependent)  96.45 
 
 		 901 aa  1761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  61.1 
 
 		 1225 aa  1097    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1979  methionine synthase  75.03 
 
 		 916 aa  1393    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  59.15 
 
 		 1224 aa  1076    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  63.48 
 
 		 1236 aa  1138    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  60.13 
 
 		 1233 aa  1103    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3658  hypothetical protein  60.66 
 
 		 900 aa  1068    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0544622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  60.22 
 
 		 1239 aa  1108    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  63.62 
 
 		 1245 aa  1127    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  60.57 
 
 		 1244 aa  1108    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  52.2 
 
 		 1252 aa  959    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2399  methionine synthase (B12-dependent)  58.51 
 
 		 902 aa  1001    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  66.52 
 
 		 1267 aa  1252    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  61.73 
 
 		 1227 aa  1097    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  93.26 
 
 		 905 aa  1745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0014  methionine synthase  71.93 
 
 		 911 aa  1348    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  94.03 
 
 		 905 aa  1732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1510  methionine synthase  59.65 
 
 		 891 aa  1066    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  54.19 
 
 		 1259 aa  924    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  64.17 
 
 		 1304 aa  1155    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3206  methionine synthase (B12-dependent)  59.33 
 
 		 878 aa  1007    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336651  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0147  methionine synthase (B12-dependent)  72.34 
 
 		 912 aa  1349    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.287887  normal  0.989958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0466  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  70.04 
 
 		 965 aa  1389    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  60.67 
 
 		 1233 aa  1098    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  63.07 
 
 		 1286 aa  1141    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  73.51 
 
 		 1262 aa  1382    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0174  methionine synthase (B12-dependent)  72.91 
 
 		 944 aa  1398    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4243  methionine synthase (B12-dependent)  92.6 
 
 		 905 aa  1712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  60.53 
 
 		 1241 aa  1108    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  62.5 
 
 		 1251 aa  1124    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  64.5 
 
 		 1293 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  63.7 
 
 		 1245 aa  1162    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  61.85 
 
 		 1261 aa  1129    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  55.98 
 
 		 1271 aa  999    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  85.64 
 
 		 915 aa  1603    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1848  methionine synthase (B12-dependent)  59.78 
 
 		 909 aa  1071    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  57.56 
 
 		 1226 aa  1003    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  59.85 
 
 		 913 aa  1085    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.88 
 
 		 873 aa  997    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2303  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  97.24 
 
 		 905 aa  1813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  62.1 
 
 		 1220 aa  1130    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  61.98 
 
 		 1264 aa  1122    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1434  methionine synthase (B12-dependent)  59.76 
 
 		 897 aa  1100    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  63.27 
 
 		 1287 aa  1134    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  62.57 
 
 		 1261 aa  1130    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1244 aa  1115    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1244 aa  1115    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  64.38 
 
 		 1245 aa  1160    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  59.69 
 
 		 1238 aa  1093    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  93.15 
 
 		 905 aa  1743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2436  methionine synthase  60.4 
 
 		 885 aa  1033    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0619597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2966  methionine synthase  100 
 
 		 905 aa  1858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  64.01 
 
 		 1234 aa  1140    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  56.97 
 
 		 1272 aa  1013    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2917  methionine synthase  97.24 
 
 		 905 aa  1813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  59.8 
 
 		 1220 aa  1055    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  60.57 
 
 		 1244 aa  1114    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  63 
 
 		 1235 aa  1141    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  93.26 
 
 		 905 aa  1745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  59.14 
 
 		 1249 aa  1090    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  61.39 
 
 		 1250 aa  1078    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  61.79 
 
 		 1244 aa  1127    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  61.06 
 
 		 1246 aa  1120    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  62.1 
 
 		 1264 aa  1130    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  60.6 
 
 		 1227 aa  1086    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  62.87 
 
 		 1251 aa  1132    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  63.38 
 
 		 1232 aa  1155    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0168  methionine synthase (B12-dependent)  76.85 
 
 		 923 aa  1443    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.616802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0214  methionine synthase (B12-dependent)  76.22 
 
 		 907 aa  1437    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0117  methionine synthase  72.44 
 
 		 939 aa  1400    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0603491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>