More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0338 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  53.89 
 
 		 337 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  54.35 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  51.85 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  50.6 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  49.24 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  44.31 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.89 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.89 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  42.46 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  43.96 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  43.73 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  41.54 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  43.69 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  42.15 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  39.81 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  42.15 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  41.64 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  38.14 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  40.74 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  39.57 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  36.36 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.59 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  39.4 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  37.16 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  34.52 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 		 667 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  36.36 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  35.42 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  36.34 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.38 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.69 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 667 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  35.01 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  34.06 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  30.97 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 667 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  41.05 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.94 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 667 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.2 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 435 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  36.71 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.2 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.02 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.03 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.2 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.76 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.94 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.47 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.48 
 
 		 670 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.21 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.21 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.55 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 405 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  35.83 
 
 		 338 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  27.47 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>