260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2092 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  90.09 
 
 
232 aa  420  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  89.66 
 
 
232 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  69.74 
 
 
232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  68.86 
 
 
232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  69.74 
 
 
232 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  71.74 
 
 
235 aa  296  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  66.52 
 
 
231 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  66.96 
 
 
232 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  59.91 
 
 
233 aa  275  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  65.2 
 
 
232 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  65.2 
 
 
232 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  63.16 
 
 
232 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  63.01 
 
 
231 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  61.21 
 
 
236 aa  255  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  59.74 
 
 
253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  63.72 
 
 
230 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  65.37 
 
 
235 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  64.84 
 
 
235 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  64.6 
 
 
232 aa  248  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  63.98 
 
 
236 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  63.27 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  62.56 
 
 
236 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  62.56 
 
 
236 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  59.35 
 
 
241 aa  235  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  64.29 
 
 
237 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  55.11 
 
 
233 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  52.38 
 
 
262 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  53.6 
 
 
260 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  47.84 
 
 
230 aa  210  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  54.02 
 
 
233 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  53.64 
 
 
250 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  54.09 
 
 
234 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  51.3 
 
 
262 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  52.73 
 
 
262 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  52.73 
 
 
262 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
220 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
220 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  46.43 
 
 
220 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
220 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
220 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  45.98 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  50.64 
 
 
237 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 
220 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.44 
 
 
220 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  48.02 
 
 
229 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  45.74 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 
220 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  51.67 
 
 
241 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  45.26 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  44.89 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.84 
 
 
224 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  48.93 
 
 
231 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  43.42 
 
 
224 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  48.05 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 
226 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  41.56 
 
 
225 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  44.74 
 
 
226 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  46.35 
 
 
230 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  43.95 
 
 
231 aa  175  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  43.96 
 
 
224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  43.78 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  44.49 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 
237 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  41.81 
 
 
227 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  38.3 
 
 
230 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  41.85 
 
 
236 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  42.98 
 
 
241 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  43.88 
 
 
250 aa  164  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  39.92 
 
 
237 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  36.48 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  36.48 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  41.41 
 
 
236 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.123747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  42.31 
 
 
228 aa  162  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  43.11 
 
 
237 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2355  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
234 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533763  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2690  ribose 5-phosphate isomerase A  41.85 
 
 
236 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  44.8 
 
 
287 aa  158  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  42.02 
 
 
236 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  44.34 
 
 
232 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  45.5 
 
 
206 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  42.52 
 
 
237 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  39.92 
 
 
239 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  42.08 
 
 
232 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  39.01 
 
 
228 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 
236 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 
228 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  41.07 
 
 
236 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  42.06 
 
 
222 aa  151  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 
232 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  40.18 
 
 
236 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  39.73 
 
 
236 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  43.9 
 
 
227 aa  148  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  42.78 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  38.24 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  39.45 
 
 
231 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  38.39 
 
 
237 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  38.99 
 
 
231 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  41.49 
 
 
240 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>