More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1235 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1235  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  41.34 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  37.6 
 
 		 296 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  34.35 
 
 		 294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.17 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  44.1 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1602  farnesyl-diphosphate synthase  39.06 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.72 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  36.82 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.72 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  35.74 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  38.2 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  38.15 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  36.55 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  35.55 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  35.55 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  35.69 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  40.86 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  40.86 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  38.24 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  40.86 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  40.86 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.29 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  37.61 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  36.04 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 299 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  34.65 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0567  farnesyl-diphosphate synthase  40.83 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  33.85 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  32.69 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.57 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  37.99 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  36.5 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  34.52 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  36.4 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  38.37 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0455  putative geranyltranstransferase  38.99 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.765692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  40.25 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  40.64 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  36.88 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  35.96 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  35.43 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  34.16 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  35.25 
 
 		 297 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  33.8 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  32.46 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  31.97 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  38.2 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  35.71 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  32.68 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  34.67 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  31.88 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  33.22 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  36.08 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  35.81 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  36.48 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  35.81 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  34.51 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  35.16 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  33.21 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  35.41 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  33.45 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  34.27 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>