More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0414 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  100 
 
 		 313 aa  653    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  51.14 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  48.97 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  44.93 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  45.39 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  39.59 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  40.27 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  39.93 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  37.79 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  39.59 
 
 		 312 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  39.53 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  39.12 
 
 		 297 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  36.49 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  39.12 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  39.12 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  40.14 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  38.1 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  37.25 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.1 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  26.33 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  29.94 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  32 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  29.9 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  31.97 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.29 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.52 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  32.21 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.25 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  30.41 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  25.15 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  30.27 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  26.18 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  29.75 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  27.48 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  25 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  28.28 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  24.38 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  27.6 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  27.95 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  24.05 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  27.62 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  28.15 
 
 		 422 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  23.95 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  23.95 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  25.17 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  26.05 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.39 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  24.66 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  28.99 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  25.4 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  26.88 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  26.18 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  24.76 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  29.63 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  29.63 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  25.36 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  25.2 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  26.64 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  27.88 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  28.69 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  28.7 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  25.97 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  25.31 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.77 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  25.31 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  26.24 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  26.24 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  29.18 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  26.32 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  25.75 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  24.03 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  26.67 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26 
 
 		 457 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  28.21 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  24.03 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  27.05 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  25.42 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  26.7 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  24.8 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  26.2 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  26.03 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  25 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  25.33 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  24.66 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  24.27 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  26.58 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  24.35 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  28.64 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  25.39 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  24.07 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>