More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4222 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  100 
 
 		 270 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  49.62 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  49.62 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.09 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  47.67 
 
 		 263 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.08 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.54 
 
 		 277 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.26 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  42.12 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  48.46 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  46.54 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  46.72 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  42.54 
 
 		 288 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  43.28 
 
 		 273 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  49.81 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  48.47 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  46.24 
 
 		 275 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  42.48 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.45 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  45.42 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.19 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  47.95 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.18 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.85 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  39.85 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.19 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  43.54 
 
 		 281 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  42.91 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  43.12 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  43.12 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  42.11 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40.15 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.15 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  40.15 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.57 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.41 
 
 		 275 aa  218  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.57 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  42.23 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  41.41 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  41.6 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.06 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  41.6 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  42.11 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.44 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  41.42 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  40.7 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.86 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.86 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.64 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  44.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.08 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.08 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  42.28 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  41.04 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  44.15 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  40.44 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  39.26 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  41.22 
 
 		 689 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  41.7 
 
 		 606 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  40.42 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  39.7 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  41.89 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  40.89 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.85 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  40.89 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  38.78 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  39.09 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  40.91 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  40.22 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  39.62 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  43.78 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  39.53 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  40.82 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.2 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.72 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  41.39 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  40.82 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  41.39 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  41.39 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  41.06 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  39.31 
 
 		 640 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  39.76 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  39.92 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  44.71 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  40.75 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  38.68 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  36.64 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  42.31 
 
 		 612 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  39.02 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>