226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1831 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
451 aa  874    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  59.05 
 
 
338 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  54.9 
 
 
338 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  54.95 
 
 
339 aa  338  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  53.67 
 
 
338 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  53.78 
 
 
350 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  52.52 
 
 
341 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 
354 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  48.69 
 
 
344 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  49.41 
 
 
356 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  48.5 
 
 
315 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  46.26 
 
 
359 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  48.57 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  45.75 
 
 
349 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  44.71 
 
 
347 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  44.62 
 
 
339 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  42.12 
 
 
351 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  44.62 
 
 
338 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  44.62 
 
 
338 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  44.62 
 
 
338 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  46.3 
 
 
344 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  42.99 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  42.28 
 
 
339 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
355 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  37.95 
 
 
355 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
355 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
355 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  36.51 
 
 
355 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.42 
 
 
356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.42 
 
 
356 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
348 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
356 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
348 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 
344 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  39.7 
 
 
362 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
344 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.68 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  39.67 
 
 
353 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
342 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 
361 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  39.3 
 
 
343 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
352 aa  186  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.13 
 
 
349 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
363 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 
343 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  35.78 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 
343 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 
343 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
357 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
343 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 
368 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  35.36 
 
 
361 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  34.5 
 
 
362 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 
350 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 
379 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  38.31 
 
 
357 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
344 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 
352 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
348 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
358 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.69 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  37.9 
 
 
344 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  35.84 
 
 
343 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
343 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 
364 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
354 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 
359 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
354 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 
358 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  35.89 
 
 
368 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  35.23 
 
 
361 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  39.65 
 
 
355 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
346 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
353 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
358 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  35.92 
 
 
336 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 
347 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 
351 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 
391 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
429 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.16 
 
 
815 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 
353 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
388 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 
337 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  36.92 
 
 
368 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 
354 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
355 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  36.63 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>