73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2930 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  57.52 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  58.04 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  58.41 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  52.21 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  50.62 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  48.15 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1431  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  34.34 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 218 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  43.55 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 196 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.62 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 252 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  27.59 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  52.78 
 
 		 508 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 183 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>