More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0320 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0320  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.82 
 
 
501 aa  159  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.99 
 
 
514 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.23 
 
 
483 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.85 
 
 
504 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.17 
 
 
507 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.99 
 
 
542 aa  141  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
478 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
477 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.61 
 
 
482 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.48 
 
 
498 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  38.18 
 
 
502 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  36.65 
 
 
481 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.85 
 
 
501 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.87 
 
 
493 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 
524 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
501 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.75 
 
 
525 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.18 
 
 
532 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  39.38 
 
 
530 aa  111  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.8 
 
 
486 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.8 
 
 
533 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.24 
 
 
462 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 
518 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.95 
 
 
488 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.11 
 
 
517 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 
511 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.73 
 
 
500 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 
504 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 
516 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
509 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.99 
 
 
499 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.73 
 
 
498 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.04 
 
 
498 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.72 
 
 
528 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
533 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.24 
 
 
530 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.46 
 
 
513 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.08 
 
 
514 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.18 
 
 
515 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.46 
 
 
521 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.9 
 
 
519 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  33.78 
 
 
522 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.41 
 
 
512 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.49 
 
 
513 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.77 
 
 
499 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.49 
 
 
520 aa  95.5  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.41 
 
 
492 aa  94.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.31 
 
 
517 aa  94.7  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2045  hypothetical protein  30.6 
 
 
548 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 
514 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 
492 aa  92.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  34.12 
 
 
507 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  30.19 
 
 
519 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 
531 aa  91.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.54 
 
 
492 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.05 
 
 
504 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
520 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 
524 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 
515 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  35.29 
 
 
458 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1143  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.11 
 
 
553 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
499 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.06 
 
 
527 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 
524 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.5 
 
 
524 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.05 
 
 
521 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.16 
 
 
513 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 
541 aa  89  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  30.41 
 
 
500 aa  88.2  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.8 
 
 
492 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 
523 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
506 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 
516 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  29.61 
 
 
523 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.85 
 
 
503 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.51 
 
 
504 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 
512 aa  86.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  31.94 
 
 
514 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  31.94 
 
 
514 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  32.06 
 
 
499 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 
499 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 
499 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  31.94 
 
 
514 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  31.48 
 
 
514 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 
556 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.22 
 
 
494 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  33.1 
 
 
500 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  31.55 
 
 
496 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.22 
 
 
502 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 
515 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.17 
 
 
513 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.37 
 
 
515 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.37 
 
 
515 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.31 
 
 
521 aa  84.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.37 
 
 
515 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.48 
 
 
514 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.37 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.37 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>