81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3730 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  100 
 
 
293 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  41.7 
 
 
319 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  35.37 
 
 
298 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.14 
 
 
862 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4122  UspA domain protein  31.67 
 
 
291 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.62 
 
 
859 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.33 
 
 
863 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  26.71 
 
 
897 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.99 
 
 
863 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 
792 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  25.44 
 
 
875 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 
820 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  23.76 
 
 
879 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  23.76 
 
 
879 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 
764 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  26.55 
 
 
732 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  27.78 
 
 
625 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 
770 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000172915  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 
786 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.15 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.24 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.9 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.58 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  22.55 
 
 
692 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 
145 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  24.7 
 
 
722 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
681 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
686 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
709 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  23.55 
 
 
604 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  24.58 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 
698 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.62 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.14 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  18.88 
 
 
753 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1938  UspA domain protein  30.43 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  24.27 
 
 
698 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  28.21 
 
 
168 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0027  UspA domain-containing protein  28.36 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
138 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.92 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
138 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.48 
 
 
415 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0028  universal stress protein  29.1 
 
 
142 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.406249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 
712 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.24 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.85 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  24.26 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  23.78 
 
 
727 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.68 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  26.57 
 
 
859 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26 
 
 
725 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  25.74 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
692 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_27  Na+/H+ antiporter C-terminal domain/universal stress protein-like protein  28.36 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.547805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.97 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
747 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  23.91 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.94 
 
 
140 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  23.18 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
688 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  21.72 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  23.99 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  21.43 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
155 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  23.2 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  27.21 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.38 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.39 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  21.28 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.07 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  23.89 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
143 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  24.19 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>