45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4122 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4122  UspA domain protein  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  59.45 
 
 
298 aa  338  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  33.92 
 
 
319 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  31.88 
 
 
293 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 
792 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.09 
 
 
859 aa  95.5  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.06 
 
 
862 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  24.64 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  25.09 
 
 
879 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  25.09 
 
 
879 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  28.19 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 
770 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 
764 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  24.47 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  23.11 
 
 
692 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
745 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 
820 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.32 
 
 
897 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  23.27 
 
 
863 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  27.45 
 
 
732 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  22.56 
 
 
679 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 
722 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  25.96 
 
 
604 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25 
 
 
773 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 
712 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.62 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 
156 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 
786 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
689 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  40.32 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  22.84 
 
 
698 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  22.84 
 
 
698 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.49 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.69 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.87 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  24.91 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.65 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.62 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.17 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.67 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  28.26 
 
 
200 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.98 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.73 
 
 
144 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>