More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1830 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4164  transcriptional regulator, IclR family  43.36 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000832407  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  31.74 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.64 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.18 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.18 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.18 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.18 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.18 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.73 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.83 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.02 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.77 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.67 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  24.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.35 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  35.87 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.27 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.02 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  34.4 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  35.65 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.97 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>