More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5128 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  100 
 
 		 358 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  38.91 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  32.49 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  32.49 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  32.95 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  36.63 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  34.74 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  34.64 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 		 671 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 		 937 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  36.4 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.07 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.1 
 
 		 618 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  31.22 
 
 		 701 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  27.76 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  31.05 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  25.51 
 
 		 618 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  24.28 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  25.93 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.28 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  24.69 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  25.82 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  31.62 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  25.82 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  24.28 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  24.28 
 
 		 627 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  26.89 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  30.08 
 
 		 659 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  31.25 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  32.35 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  32.35 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  27.2 
 
 		 1454 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  27.27 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  31.06 
 
 		 642 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  23.61 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 		 650 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  24.21 
 
 		 505 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  31.12 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  26.59 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  26.61 
 
 		 1413 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  26.52 
 
 		 1270 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.94 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  30.22 
 
 		 1105 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  25.1 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  28.1 
 
 		 1067 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 1500 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  24.86 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  25.69 
 
 		 2199 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  30.35 
 
 		 667 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  24.43 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.15 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2553  dehydrogenase domain-containing protein  28.95 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 1485 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  27.57 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  27.57 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  29.63 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  25 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  26.07 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2213  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2502  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.06 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  25 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.06 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25.83 
 
 		 1506 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  23.78 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  26.47 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 2376 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  30.82 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  25.68 
 
 		 1421 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  27.71 
 
 		 1394 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1600  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 2374 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  26.83 
 
 		 1188 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.04 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.99 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.22 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.71 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  24.28 
 
 		 1077 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  26.42 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.65 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  26.42 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 1165 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  24.27 
 
 		 7214 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>