More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3396 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 181 aa  353  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  71.1 
 
 		 330 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  64.33 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.47 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  64.07 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  73.58 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.81 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  65.22 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  63.03 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  64.5 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.82 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  65.13 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.67 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  65.13 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  65.13 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  66.46 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  65.16 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  65.73 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.87 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.52 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  64.46 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.62 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.56 
 
 		 193 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  66.25 
 
 		 175 aa  167  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  66.47 
 
 		 172 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  62.42 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  64.29 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.58 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.58 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  61.54 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  61.54 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.68 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  58.08 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  61.9 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  48.39 
 
 		 156 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.19 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  44.58 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  55.48 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.1 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  58.94 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.89 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  40.61 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.65 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.01 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.36 
 
 		 166 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36.02 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.21 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.17 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  42.24 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  40.52 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  41.98 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.22 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.38 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.15 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.46 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  41.44 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  41.44 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.74 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  41.44 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.51 
 
 		 179 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.82 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  42.77 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  39.46 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  38.82 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.61 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  37.8 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  38.27 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.23 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.65 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.58 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>