289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0531 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  100 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  55.56 
 
 
221 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  49.76 
 
 
210 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  48.37 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  46.64 
 
 
227 aa  165  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  45.67 
 
 
217 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  44.6 
 
 
216 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  48.76 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  48.76 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  48.76 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  46.38 
 
 
206 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  43.54 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  43.07 
 
 
206 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
243 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  46.57 
 
 
206 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
211 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  45.37 
 
 
218 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  48.74 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  40.29 
 
 
208 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  39.22 
 
 
208 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41.18 
 
 
211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  47.37 
 
 
189 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  40.27 
 
 
396 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  42.29 
 
 
198 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  40.1 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  40 
 
 
204 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  44.93 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  40.53 
 
 
223 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  43.63 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
253 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  45.51 
 
 
197 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
226 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 
217 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40.69 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  41.83 
 
 
207 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  37.44 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  36.95 
 
 
544 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  43.75 
 
 
410 aa  88.2  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  38.25 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.18 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  35.84 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  32 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.52 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.61 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  31.29 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  35.4 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  35.44 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  46.07 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  27.74 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  43 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  33.57 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  33.33 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.03 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  31.16 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  37.98 
 
 
198 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  36.6 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  28.75 
 
 
201 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.52 
 
 
277 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  31.85 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  30.5 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
149 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  41.96 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  40 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.82 
 
 
541 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  33.09 
 
 
541 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 
541 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  31.91 
 
 
541 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
257 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  26 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  26 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  26 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  23.88 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>