More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0489 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  100 
 
 		 344 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  57.23 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  55 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  55.75 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  55.75 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  55.75 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  55.92 
 
 		 394 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  54.87 
 
 		 354 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  52.68 
 
 		 353 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  50.88 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  53.14 
 
 		 362 aa  322  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  51.25 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  49.26 
 
 		 351 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  51.76 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  38.82 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.42 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 418 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  33.23 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  33.14 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.65 
 
 		 430 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  34.56 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  36.11 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.13 
 
 		 395 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  32.05 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  30.36 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  27.46 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.62 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  31.92 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  32.65 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.81 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.52 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  35.94 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  30.09 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  34.7 
 
 		 834 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.4 
 
 		 408 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.5 
 
 		 466 aa  155  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  30.72 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  32.94 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 		 409 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  36.09 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.99 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  34.07 
 
 		 436 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.36 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  36.98 
 
 		 463 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  34.15 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  30.2 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  32.77 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  32.64 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  34.8 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  35.34 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  32.63 
 
 		 385 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  29.2 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  36.09 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  38.42 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  32.64 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  38.42 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  30.7 
 
 		 411 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  34.12 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  38.42 
 
 		 452 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  30.72 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  32.18 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  34.72 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  31.42 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  36.92 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  26.69 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  29.36 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  35.47 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.87 
 
 		 489 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 481 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.04 
 
 		 458 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  30.86 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>