50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6043 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1193    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  46.61 
 
 		 569 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  52.29 
 
 		 584 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  52.29 
 
 		 584 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  52.29 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  50.61 
 
 		 1058 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  48.53 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  33.45 
 
 		 342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  31.42 
 
 		 909 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  34.78 
 
 		 815 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  31.52 
 
 		 997 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  39.6 
 
 		 2305 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 885 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  38.66 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  33.52 
 
 		 906 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.07 
 
 		 1867 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  44 
 
 		 1416 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.11 
 
 		 880 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  28.44 
 
 		 2310 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  28 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  25.9 
 
 		 3378 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  47.54 
 
 		 1512 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.74 
 
 		 3927 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  28.37 
 
 		 666 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  44 
 
 		 4978 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.7 
 
 		 5745 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  40.79 
 
 		 139 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.58 
 
 		 1884 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.49 
 
 		 1063 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.35 
 
 		 2377 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.81 
 
 		 4798 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  32 
 
 		 974 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1046 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  37.8 
 
 		 565 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  37.93 
 
 		 910 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.11 
 
 		 2114 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.61 
 
 		 2807 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  45.24 
 
 		 1597 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1949 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.19 
 
 		 1056 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.33 
 
 		 1712 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  42.59 
 
 		 157 aa  44.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 927 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  45.28 
 
 		 4231 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.38 
 
 		 1141 aa  44.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  28.57 
 
 		 887 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.16 
 
 		 1067 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  40.38 
 
 		 4896 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  48.98 
 
 		 4748 aa  43.9  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>