More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3115 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  69.83 
 
 
234 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  36.62 
 
 
221 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  33.92 
 
 
223 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  33.33 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  32.58 
 
 
213 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  32.58 
 
 
213 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  32.58 
 
 
213 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  32.27 
 
 
213 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  31.72 
 
 
241 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  33.94 
 
 
280 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  30.84 
 
 
223 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  32.3 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  32.14 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  32.14 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  32.14 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  30.77 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  30 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  31.13 
 
 
228 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  27.35 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  27.94 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  26.36 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  29.86 
 
 
546 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  27.88 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  33.17 
 
 
190 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  28.05 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.47 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  31.39 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  30.37 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.47 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  28.07 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.48 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  29.63 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  28.45 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  28.51 
 
 
219 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.12 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.14 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  29.86 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.64 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.75 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.02 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.54 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  25 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.54 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.1 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.48 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.05 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.77 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.92 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.04 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.62 
 
 
350 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.13 
 
 
348 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.24 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.92 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.45 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.12 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.79 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.42 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  27.81 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.63 
 
 
204 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.5 
 
 
170 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.29 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  25.33 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  27.37 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  29.41 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.15 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.13 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.29 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  23.38 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.48 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.39 
 
 
177 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  23.38 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.47 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  30.39 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  23.68 
 
 
169 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.04 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.84 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.73 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.03 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.54 
 
 
169 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.94 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 
219 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.64 
 
 
178 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  22.82 
 
 
170 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.64 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  27.54 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.7 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  27.05 
 
 
169 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>