170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2454 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  100 
 
 
344 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  86.38 
 
 
323 aa  511  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  77.1 
 
 
321 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  77.1 
 
 
321 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  77.1 
 
 
321 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  71.61 
 
 
324 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  46.31 
 
 
402 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  51.92 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  47.88 
 
 
404 aa  242  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  51.41 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  47.66 
 
 
426 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  43.67 
 
 
356 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  46.79 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  42.07 
 
 
354 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  35.71 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  36.36 
 
 
327 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  36.53 
 
 
342 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  36.46 
 
 
336 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  31.56 
 
 
300 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  33.86 
 
 
324 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  32.31 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  33.06 
 
 
355 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  31.91 
 
 
361 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  24.61 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.1 
 
 
316 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  28.19 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.08 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.72 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.11 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.57 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.28 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.7 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.11 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.1 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  23.9 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  25.42 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.32 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  26 
 
 
296 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  26.32 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  23.33 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.96 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  26.49 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.1 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.05 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.74 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  27.32 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.42 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  24.83 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  29.27 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  29.27 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.59 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  21.4 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  21.4 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.85 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  24.17 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.93 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  20.21 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  20.21 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.77 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  20.73 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  23.13 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  21.05 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.99 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.99 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  20.35 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  22.73 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.87 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.35 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.04 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.14 
 
 
277 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  24.67 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  26.64 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  23.33 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  23.47 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  22.3 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.87 
 
 
371 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.28 
 
 
388 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.82 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.94 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  26.1 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  27.12 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.31 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  25.1 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.91 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  20.96 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.36 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.74 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  26.69 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.27 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.86 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  30.23 
 
 
420 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  22.46 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  21.93 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  24.11 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  22.84 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>