More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0890 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  53.17 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  28.43 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  30.27 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  29.73 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  29.73 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  29.73 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  28.27 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  25.12 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  27.69 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.6 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.72 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.05 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  25.87 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  22.97 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  25 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28.48 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 332 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  26.67 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  25.62 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.14 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.49 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  25.5 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  25.9 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.91 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  22.89 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 350 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  27.67 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>