More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2498 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  74.19 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1185  membrane protease  34.88 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  30.65 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  26.84 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08236  hypothetical protein  28.97 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  30 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  30.93 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3100  band 7 protein  24.36 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1957  band 7 protein  29.82 
 
 		 360 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0179  band 7 protein  26.89 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  28.67 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  30.36 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00780  prohibitin PHB1, putative  31.54 
 
 		 274 aa  95.9  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  29.31 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2108  SPFH domain-containing protein  30.27 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06073  putative prohibitin (Eurofung)  29.23 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.453994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2167  hypothetical protein  29.54 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.772353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1730  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.94 
 
 		 437 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0295  SPFH domain-containing protein  29.71 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0317  SPFH domain-containing protein  29.71 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.134016  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49447  predicted protein  30.88 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1708  SPFH domain-containing protein  28.33 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3709  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25.08 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41824  predicted protein  30.83 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.699109  normal  0.209561 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1405  conserved hypothetical transmembrane protein (SPFH domain / Band 7 family)  28.24 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54960  predicted protein  30.45 
 
 		 269 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0825  band 7 protein  31.28 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  27.37 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54958  prohibitin-like protein  28.17 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  27.37 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1876  Band 7 protein  27.96 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1448  SPFH domain-containing protein  25.5 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00686  prohibitin complex subunit Phb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13470)  28.28 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  27.78 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76983  predicted protein  27.71 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29372  predicted protein  25.26 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12799  prohibitin-like protein  27.47 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1062  band 7 protein  24.56 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4360  band 7 protein  26.24 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3569  membrane protease subunit  28.11 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0815  band 7 protein  28.57 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000157152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.97 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00070  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  29.39 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0445  hflC protein, putative  23.78 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  28.52 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  25.74 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  24.13 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3398  band 7 protein  25 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0448  band 7 protein  25 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3581  band 7 protein  25 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  29.28 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  29.57 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0423  band 7 protein  24.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4033  band 7 protein  24.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3837  band 7 protein  24.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.712498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3910  band 7 protein  24.2 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  24.31 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2811  band 7 protein  28.05 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103679  hitchhiker  0.00246808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  24.56 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  27.15 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  27.06 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  26.23 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.69 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3650  band 7 protein  26.71 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3545  band 7 protein  27.82 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.978436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  27.66 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  26.77 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  26.77 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  25.3 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  26.77 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  26.77 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  27.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  24.31 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  24.65 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3042  band 7 protein  22.97 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  24.42 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3018  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.21 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  23.99 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  25.19 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0051  hypothetical protein  29.79 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.10901e-82  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  28.06 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1663  hypothetical protein  26.91 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  26.91 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  25.68 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  24.16 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  26.91 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  23.81 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  29.26 
 
 		 830 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5185  band 7 protein  25.41 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.133466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  26.61 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  26.61 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  26.1 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  23.88 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  24.31 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1182  membrane protease  25.88 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  26.24 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  24.76 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>