123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6128 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  700    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  92.07 
 
 		 353 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  81.71 
 
 		 353 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  81.42 
 
 		 353 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  33.22 
 
 		 649 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  33.22 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  36.49 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  31.93 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.9 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  32.92 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  25.33 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  28.23 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  33.78 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  26.99 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  33.23 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  29.41 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.58 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  26.78 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  30.61 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  28.85 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  30.4 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  29.7 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  29.57 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  28.87 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.33 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  29.94 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  33.12 
 
 		 408 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  30.49 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  27.84 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  28.62 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  29.25 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  32.01 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  27.06 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  29.9 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  28.33 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  24.67 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  28.18 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  30.25 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  26.12 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  29.56 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  27.39 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  29.75 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  25.68 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  25.68 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  28.81 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  25.76 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  27.99 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  26.12 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  29.2 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  25 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  22.85 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  26.59 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  25 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  24.62 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  24.62 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  25.1 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  22.95 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  28.14 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  26.2 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  27.33 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  23.03 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  23.63 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  23.63 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  27.59 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  31.83 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  21.67 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  26.69 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  34.48 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  21.67 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  21.33 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  29.09 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  27.12 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  27.59 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  25.5 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  26.1 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  27.01 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  29.1 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  26.58 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>