92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5645 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  56.25 
 
 
355 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  49.59 
 
 
644 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  62.65 
 
 
115 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  57.3 
 
 
120 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  55.79 
 
 
137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  60.98 
 
 
137 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  60.98 
 
 
137 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  57.32 
 
 
1806 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  56.1 
 
 
1632 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  56.41 
 
 
592 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  52.81 
 
 
322 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  53.66 
 
 
2796 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  56.1 
 
 
361 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  56.1 
 
 
361 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  56.1 
 
 
361 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  51.09 
 
 
521 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  52.7 
 
 
678 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  56.34 
 
 
2342 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  56.34 
 
 
2342 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
872 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 
665 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  50.7 
 
 
849 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 
746 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  53.16 
 
 
680 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  43.42 
 
 
1264 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
857 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  52.11 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  51.28 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  48.75 
 
 
756 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
1067 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
1152 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
1152 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  51.95 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  51.95 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
995 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
1059 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  47.89 
 
 
1035 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  35.11 
 
 
537 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  45.24 
 
 
1476 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
1247 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  34.04 
 
 
537 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  42.86 
 
 
1366 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  50.75 
 
 
535 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  46.75 
 
 
1302 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  43.94 
 
 
987 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  37.33 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  37.84 
 
 
363 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  47.14 
 
 
1044 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  50.55 
 
 
830 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 
1322 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  37.27 
 
 
1880 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  32.52 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 
1313 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  42.25 
 
 
814 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  38.03 
 
 
518 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  40.77 
 
 
1313 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 
1317 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  47.76 
 
 
597 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  42.47 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.67 
 
 
1161 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 
2296 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  32.29 
 
 
452 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  32.29 
 
 
418 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
461 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  38.57 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.62 
 
 
916 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  31.82 
 
 
256 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
1301 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
1236 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.3 
 
 
418 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
882 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 
462 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2784  hypothetical protein  32.22 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.188398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  36.21 
 
 
513 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1122  hypothetical protein  32.22 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
846 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1737 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.26 
 
 
751 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  36.26 
 
 
751 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  39.62 
 
 
1162 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  63.64 
 
 
668 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  35.48 
 
 
603 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  52.78 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  52.78 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 
880 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  51.52 
 
 
297 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3238  hypothetical protein  31.25 
 
 
296 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
958 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  31.25 
 
 
1449 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  48.48 
 
 
1334 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>